Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RAB40BQ12829 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms