Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN1Q04323 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms