Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ID4P47928 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ID4P47928 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ID4P47928 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms