Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTGDSP41222 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTGDSP41222 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms