Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms