Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms