Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTA1P02549 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTA1P02549 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTA1P02549 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTA1P02549 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms