Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms