Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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