Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHMG1C9JSJ3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms