Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y616

IRAK3, Interleukin-1 receptor-associated kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK3Q9Y616 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRAK3Q9Y616 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRAK3Q9Y616 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRAK3Q9Y616 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms