Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX10Q9Y5X0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX10Q9Y5X0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX10Q9Y5X0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms