Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NR2E1Q9Y466 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NR2E1Q9Y466 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR2E1Q9Y466 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms