Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SETD1BQ9UPS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SETD1BQ9UPS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETD1BQ9UPS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETD1BQ9UPS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms