Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A2Q9UPR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A2Q9UPR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A2Q9UPR5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms