Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX7Q9UNH6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX7Q9UNH6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms