Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA12Q9UN75 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA12Q9UN75 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms