Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHTF1Q9UMS5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHTF1Q9UMS5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms