Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT6Q9ULM6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT6Q9ULM6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT6Q9ULM6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms