Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HCN2Q9UL51 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HCN2Q9UL51 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN2Q9UL51 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms