Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA3Q9UL41 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA3Q9UL41 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA3Q9UL41 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms