Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSRAQ9UJ68 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSRAQ9UJ68 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSRAQ9UJ68 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRAQ9UJ68 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms