Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK1NQ9UHG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK1NQ9UHG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK1NQ9UHG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK1NQ9UHG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCSK1NQ9UHG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCSK1NQ9UHG2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCSK1NQ9UHG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCSK1NQ9UHG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms