Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA9Q9UGM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA9Q9UGM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA9Q9UGM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms