Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CFDP1Q9UEE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CFDP1Q9UEE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CFDP1Q9UEE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFDP1Q9UEE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFDP1Q9UEE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms