Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKX1-2Q9UD57 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX1-2Q9UD57 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms