Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLN8Q9UBY8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLN8Q9UBY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms