Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DKK4Q9UBT3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DKK4Q9UBT3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK4Q9UBT3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK4Q9UBT3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms