Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPR1Q9UBH6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPR1Q9UBH6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPR1Q9UBH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPR1Q9UBH6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms