Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
REREQ9P2R6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
REREQ9P2R6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
REREQ9P2R6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
REREQ9P2R6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
REREQ9P2R6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms