Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL20A1Q9P218 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL20A1Q9P218 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL20A1Q9P218 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL20A1Q9P218 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL20A1Q9P218 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
COL20A1Q9P218 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL20A1Q9P218 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COL20A1Q9P218 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms