Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCHIP1Q9P0W5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCHIP1Q9P0W5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms