Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L2

MARK1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK1Q9P0L2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK1Q9P0L2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MARK1Q9P0L2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARK1Q9P0L2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms