Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF4Q9P032 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFAF4Q9P032 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF4Q9P032 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms