Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNIH4Q9P003 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH4Q9P003 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH4Q9P003 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms