Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCKIPSDQ9NZQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCKIPSDQ9NZQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms