Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD3Q9NZN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHD3Q9NZN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms