Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A12Q9NXJ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms