Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN6Q9NWW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN6Q9NWW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms