Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OXSMQ9NWU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OXSMQ9NWU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OXSMQ9NWU1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OXSMQ9NWU1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms