Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLR3EQ9NVU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR3EQ9NVU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms