Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACER3Q9NUN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACER3Q9NUN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACER3Q9NUN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms