Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCM2LQ9NUG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCM2LQ9NUG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms