Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SALL1Q9NSC2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SALL1Q9NSC2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SALL1Q9NSC2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SALL1Q9NSC2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms