Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPHK2Q9NRA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPHK2Q9NRA0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms