Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL1Q9NR64 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL1Q9NR64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms