Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PFDN4Q9NQP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN4Q9NQP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms