Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms