Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCUBE2Q9NQ36 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE2Q9NQ36 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms