Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP13A2Q9NQ11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A2Q9NQ11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A2Q9NQ11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms